En médecine moderne, la combinaison de données génomiques, cliniques et d’imagerie tend à se généraliser pour le développement de nouvelles approches diagnostiques et pronostiques. INEX-MED est un projet pilote en biologie intégrative de l’Institut Français de Bio-informatique (IFB). Il vise à développer une infrastructure de données et d’algorithmes FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) pour l’intégration, l’exploitation et la modélisation (sémantique/statistique) à partir de sources de données biomédicales massives et hétérogènes. Cette infrastructure sera exploitée et validée via des approches intégratives afin d’améliorer les diagnostics/pronostics pour (i) l’étude de la formation et du développement des anévrismes intracrâniens, et (ii) l’aide au diagnostic des différentes formes de myopathies. L'Institut Français de Bio-informatique (IFB) est l’infrastructure nationale de service en bio-informatique créée dans le cadre du programme national des Investissements d'Avenir. L’IFB fédère 31 plateformes régionales de bio-informatique dont les plateformes BiRD à Nantes et BiSTRO à Strasbourg.
Dans un contexte fortement interdisciplinaire, et en collaboration avec les ingénieurs, chercheurs et cliniciens du projet, l’ingénieur(e) recruté(e) aura pour objectif de développer une infrastructure sécurisée de données liées (Linked Data) et de constituer une base de connaissances intégrant des données cliniques, génomiques, et d’imagerie. L’accent sera mis sur la réalisation d’une infrastructure générique, modulaire et portable sur les ressources de l’IFB et réutilisable par l’ensemble de la communauté biomédicale.
L’ingénieur(e) recruté(e) aura pour principales missions :
Envoyer par email CV et lettre de motivation à inexmed-all@univ-nantes.fr.